Od 1 maja 2004 r. obowiązują przepisy o podatku VAT, według których obrotem są również otrzymane dotacje. Dla firm świadczących usługi publicznego transportu zbiorowego, działających jako przedsiębiorstwa państwowe, spółki akcyjne lub z o.o., oznacza to, że muszą zaliczać do swojego obrotu dopłaty do przewozów uzyskane od samorządów. Aktualnie płacą go przewoźnicy, zmieniana ustawa o VAT podatkiem obciąży samorządy.